Theo Bộ Tài chính - đơn vị được giao soạn thảo Nghị định số 11/2024/NĐ-CP, việc Chính phủ ban hành nghị định trên nhằm xây dựng khung pháp lý làm cơ sở triển khai thực hiện các dự án đầu tư theo hợp đồng BT (hợp đồng Xây dựng – Chuyển giao); thúc đẩy hoạt động đổi mới sáng tạo và khởi nghiệp trong các lĩnh vực ưu tiên trên địa bàn TP. HCM.
Về doanh nghiệp: Chính phủ quyết định, doanh nghiệp khởi nghiệp sáng tạo, tổ chức khoa học và công nghệ, trung tâm đổi mới sáng tạo và các tổ chức trung gian hỗ trợ khởi nghiệp đổi mới sáng tạo (doanh nghiệp) có thu nhập từ hoạt động khởi nghiệp đổi mới sáng tạo phát sinh trên địa bàn, sẽ được miễn thuế thu nhập doanh nghiệp đối với khoản thu nhập này.
Các doanh nghiệp này phải đáp ứng được các quy định của Hội đồng nhân dân TP. HCM về lĩnh vực ưu tiên; tiêu chí, điều kiện, nội dung hoạt động khởi nghiệp đổi mới sáng tạo.
Doanh nghiệp được miễn thuế trong 5 năm, bắt đầu từ thời điểm doanh nghiệp phát sinh thuế thu nhập phải nộp cho hoạt động khởi nghiệp đổi mới sáng tạo phát sinh trên địa bàn TP. HCM và trong thời gian Nghị quyết số 98/2023/QH15 về thí điểm cơ chế, chính sách đặc thù cho TP. HCM có hiệu lực.
Sau khi Nghị quyết số 98/2023/QH15 hết hiệu lực thi hành mà thời gian miễn thuế chưa kết thúc, doanh nghiệp tiếp tục thực hiện cho đến khi kết thúc thời gian miễn thuế.
Trường hợp đang trong thời gian miễn hoặc thuộc diện miễn thuế thu nhập doanh nghiệp khác thì doanh nghiệp sẽ được lựa chọn hình thức hưởng miễn thuế.
Thời điểm Nghị quyết số 98/2023/QH15 có hiệu lực thi hành, tổ chức có thu nhập từ chuyển nhượng vốn góp, quyền góp vốn vào doanh nghiệp khởi nghiệp sáng tạo trên địa bàn TP. HCM cũng được miễn thuế thu nhập doanh nghiệp cho khoản thu nhập này.
Với cá nhân: Chính phủ quy định "cá nhân có thu nhập từ chuyển nhượng vốn góp, quyền góp vốn vào doanh nghiệp khởi nghiệp sáng tạo trên địa bàn TP. HCM được miễn thuế thu nhập cá nhân với khoản thu nhập này". Quy định này được áp dụng đồng thời với thời gian Nghị quyết 98 có hiệu lực thi hành.
Thu nhập từ chuyển nhượng vốn, quyền góp vốn quy định tại khoản này là thu nhập có được từ chuyển nhượng một phần hoặc toàn bộ số vốn, quyền góp vốn vào doanh nghiệp khởi nghiệp sáng tạo trên địa bàn TP. HCM (bao gồm cả trường hợp bán doanh nghiệp), trừ thu nhập từ chuyển nhượng cổ phiếu, trái phiếu, chứng chỉ quỹ và các loại chứng khoán khác theo quy định.
Ngoài ra, trường hợp bán toàn bộ doanh nghiệp do cá nhân làm chủ sở hữu dưới hình thức chuyển nhượng vốn có gắn với bất động sản, phải kê khai và nộp thuế thu nhập cá nhân theo hoạt động chuyển nhượng bất động sản.
Việc xác định thu nhập từ chuyển nhượng vốn, quyền góp vốn và kê khai với cơ quan thuế thực hiện theo pháp luật về thuế thu nhập cá nhân, pháp luật về quản lý thuế.
